Так вроде последняя же версия...
Пока методом научных изысканий до конца проблему решить не удалось.
Но есть несколько мыслей, куда копать:
1) Наличие SSL - проверено, что не влияет.
2) Домен 2-го ур. - не проверено, но демо скрипта на сайте производителя работает на поддоменах.
3) В настройках магазина "Статус заказа по умолчанию для отправки эл.письма покупателю" - нужно указать правильные статусы для отправки письма (то есть не ВСЕ или НЕТ, а актуальные)
4) Почта с того же домена - не изучено, но есть вероятность, что идёт какая-то проверка на уровне скрипта.
5) Не дружит с SEF - проверено, не влияет.
6) Лицензионный ключ скрипта - не проверено. Но у других же работает. Но возможно в новой версии авторы скрипта это добавили.
7) Иные настройки - валюта, страны, статусы заказов и прочее - надо тестировать.