Совершенно не понимаю странных манипуляций ТС по переносу. Зачем переносить на поддомен старый сайт? Делать редиректы со старого сайта на новый (т.е. получается с неизвестного поисковику поддомена на корневой домен, на который зальется не подготовленный еще новый сайт). В общем, какой-то дурдом.
Все махинации по подготовке нового сайта сделайте на dev-версии сайта (т.е. рабочей). Можете развернуть ее на поддомене (только закройне от поисковых систем), можете на отдельном домене (то же самое), а можете вообще на локалке. И пока не доработаете его под все необходимые критерии, позволяющие обеспечить сохранение позиций и трафика - никуда ничего не размещайте. Когда вы это сделаете - просто перезалейте (ну, а старую версию само собой сохраните).
А вот критерии:
1. Все страницы вашего сайта, которые есть в индексе должны не потеряться на новом сайте. Для этого ведите site:<адрем вашего сайта> в поисковую систему и получите список всех ваших страниц. По каждому из урлов проверьте чтоб был 200 ответ у вашего нового сайта. Если вы его разместили на поддомене - это будет проще проверить автоматически (особенно, если сайт большой).
2. Все страницы, на которые вы решили забить (например, старая CMS генерила "мусорные" страницы) - определите для них перенаправления 301ми редиректами (на как можно более подходящие по смыслу, не обязательно все "неугодное" редиректить на главную, как обычно делают).
3. Проследите, чтобы контент на наиболее трафиковых страницах не изменился, или изменился не сильно. Для этого сделайте выгрузку из Google Search Console топ20, 50, 100 (на сколько хватит времени и терпения) страниц и проверьте каждую вручную.
Остается только один момент, который может повлиять на позиции - код страниц сайта, который в любом случае измениться при переходе на новую CMS. Но, думаю, если цмс-ка новая - она явно будет с лучшим кодом, которые еще больше понравиться поисковикам и позиции наоборот могут подрасти.
Ну, и будьте готовы, что вас все же может "потрясти" в позициях, т.к. поисковики не мгновенно реагируют на все изменения. В остальном же, если будете следовать приведенным выше правилам - никуда ваш трафик не денеться.