Лидирует Шоп-Скрипт, это в принципе и понятно, он изначально позиционировался как лучший-российский-вариант-без-дополнительных-заморочек. И пускай заморочек избежать не удалось, мой выбор всеравно падает именно на него. Вообще показательное голосование.
Навороченный phpshop пользуется популярностью всего у 3-х %. Хотя также отечественный. Но здесь немаловажный фактор - стоимость. Она у него зашкаливает... имхо. Да и настраивать его нужно... прямо скажем не 5 минут.
Ещё одна "родная" разработка - shopcms также не пользуеться популярностью. Ситуация уже лучше - 7%. И здесь фактор стоимости также даёт о себе знать. Стоимость на 1 домен очень низкая. Но почему тогда всего 7 ? А потому что за смену домена... извольте ещё раз платить. а это неизбежно. Вы же будете тестировать свой магазин для начала на бесплатном хостинге... А неограниченная лицензия по стоимости сравнима с phpshop...
Так что всё это (и гораздо большее) учитывается голосующими. И человек, решивший впервые взяться за дело интернет-бизнеса, уже будет иметь представление о том с какого российского (читай: изначально не английского) продукта ему лучше начать, чтобы избежать в будущем дополнительных проблем.