Может я и ошибаюсь, но это рекламодатели смотрят с какого сайта был переход по их ссылке.
Все просто - сайт direct.yandex.ru - для рекламодателей, а partner.yandex.ru - для вебмастеров, т.е. кто размещаетя контекстную рекламу на сайтах.
Естественно, что если клики не из дешевых, то человеку нужно знать откуда они идут. Ведь ясно, что тематика сайта далеко не всегда соответствует объявлениям. А может рекламодатель хочет, чтобы его объявления были только на тематически-подобном сайте.