Кроме IP еще может учитываться множество факторов - одинаковый движок и схожий дизайн, продвижение идет по одним и тем же ключевикам и для анкоров используются идентичные слова и фразы, для продвижения используются одни и те же сайты-профили-блоги и т.д. Чем меньше похожих/идентичных факторов, тем больше вероятность, что поисковики будут воспринимать два сайта, как не связанные друг с другом.