Это значит что если в функцию ты запихаешь не просто текст, а бинарные данные, которые обычно в показываются в таком виде @#^$%@#*R^$#%#&$ то функция, которая работает с данным бинарника, не поковеркает данные.
Наглядный пример: Zend кодированные php файлы - это бинарники.
Если их загружать по FTP в режиме ASCI -zend файл испортится - это пример бинарно небезопасной работы с файлом.